不同浓度(密度)分离液的制备: 先用9份分离液与1份8.5％ NaCl或1.5MPBS混合达到生理性渗透压，然后用生理溶液(0.85％ NaCl或0.15M PBS)稀释到所需浓度。
不连续密度梯度层的制备: 先将试管壁用牛血清湿润，除去多余血清，这种预处理可使逐层叠加的液平稳沿管壁流下，使形成满意的界面。在制备过程中一般用长针头注射器从高密度向低密度逐层放置，有时相邻两层比重相差不大时，可将液放入注射器中，小针头斜面紧贴管壁，任其自然慢慢流下。
装样：样品体积和细胞浓度根据不同细胞而异，一般加样体积不宜过大，细胞浓度也不可过高，否则会影响细胞的分离和回收。
离心：一般采用离心力为400g，时间20～25min。由于多层之间密度差别不大，因此离心机加速、降速时要慢，要平稳。
取样：当所要分离的细胞绝大部分在两层的界面时，可逐层去除液后收集界面部位的细胞;有时大部分细胞位于层中,则需要逐层收集。收获含有液的细胞经2次洗涤后可供培养或检测用。