凝胶电泳是实验室中用于从混合物中分离带电分子（如 DNA、RNA、蛋白质等）的常用技术。凝胶用于凝胶电泳。它充当分子筛。凝胶电泳中使用两种类型的凝胶，即琼脂糖和聚丙烯酰胺。凝胶和凝胶制剂的选择是凝胶电泳中要考虑的重要因素，因为应仔细控制凝胶的孔径，以便通过凝胶电泳实现分子的良好分离。凝胶电泳具有连接到凝胶两端的电场。凝胶的一端带正电荷，而另一端带负电荷。
DNA 和 RNA 是带负电荷的分子。一旦它们从凝胶的负端加载到凝胶中并施加到电场中，它们就会通过凝胶孔迁移到凝胶的带正电端。迁移的速度取决于分子的电荷和大小。较小的分子比较大的分子更容易通过凝胶孔迁移。因此，较小的分子在凝胶中行进很长的距离，而较大的分子则在很短的距离内行进。为了观察分子在凝胶上的移动，使用了特殊类型的染料。电场施加一定时间后停止，以防止分子丢失并使分子保持在其行进位置。在凝胶中可以观察到不同的条带。这些条带代表不同大小的分子。因此，凝胶电泳可用于根据分子大小区分分子。
凝胶电泳作为分子生物学中的一种制备技术被纳入各种技术中，例如 PCR、RFLP、克隆、DNA 测序、Southern 印迹、基因组作图等。