生物指示剂是已知细菌的制剂，具有稳定的，确定的抗性阈值和对各种灭菌过程的可预测响应。在实验室或无菌无尘室环境中，生物指示剂用于定期重新验证灭菌 协议并确认病原体灭活。
灭菌监测中至少使用三种不同类型的生物指示剂，每种类型都使用已知的灭菌和耐灭菌程序的细菌芽孢。生物指示剂也可以掺入两种不同的微生物。

生物指示剂–载体：
载体是包含孢子的容器（塑料，玻璃，滤纸等），并进行密封以保持微生物的活力。载体制作精良，设计成不会因生物指示剂要监测的灭菌过程而降解，因为这会损害生物指示剂的性能。包装本身还经过无菌生产程序，以确保其不含任何会影响生物指示剂稳定性或性能的污染物。

生物指示剂–悬浮：
生物指示剂也可以存在于孢子悬浮液中，然后将其直接应用于要进行灭菌程序的产品，包装或表面。有时会在无菌性监测中使用接种产品的模拟，但是通常要求显示接受接种的最终产品不会改变生物学指标的有效性，从而导致无效结果。

生物指示剂–自含指标：
独立的指示器带有包装，其中包含灭菌暴露后微生物潜伏期的恢复生长培养基。同时包含细菌孢子和生长培养基的自给式生物指示剂是封闭系统，可提供杀菌性。
自给式指示器系统的抗灭菌能力取决于灭菌剂渗透包装所花费的时间。易于渗透通过在制造级别上的组成和设计来控制。这些类型的指示剂通常包含一种染料，以指示孵育后细菌孢子的阴性或阳性生长，并且样品已准备好在灭菌过程后直接进行孵育。